反向***学:定义、原理、方法和应用(深度长文|推荐收...

时间:2023-11-21 10:35:52  热度:0°C

反向***学概念:

反向***学是***研发中的一种新技术,是指利用计算技术从病原体基因组中寻找可能的***靶点。这项技术改变了***设计,从而发现了针对多种传染病的有效***。在本文中,我们将讨论反向***学,包括其历史、原理、方法和应用。

图1;反向***学

反向***学的原理:

反向***学需要使用计算方法从病原体基因组中识别可能的***靶标。主要前提是发现病原体存活或***力所需的蛋白质,并且存在于病原体表面。然后,***可以靶向这些蛋白质,以引发免疫反应,从而预防疾病。

反向***学的历史:

然后,爱德华·詹纳(Edward Jenner)在1796年创造了“***”一词,用于从奶牛身上注射材料并将其传播给受天花影响的个体。

路易斯·巴斯德(Louis Pasteur)在1800年代发现了由微生物引起的感染,为合理的***开发过程奠定了基础,并为***学遵循的基本规则奠定了基础,该规则规定“分离,灭活和注射微生物”以制造针对所引起的疾病的***。

到20世纪末,所有***都是按照巴斯德***学规则开发的。

但随着新技术的发展,如蛋白质与其他生物分子等化学结合,以及重组DNA,***的开发取得了进一步的进展。

当克雷格·文特尔(Craig Venter)推断出第一个***生物体的“基因组”时,这彻底改变了***开发的进展。

在计算工具的帮助下,科学家们能够通过分析特定微生物的基因组来设计***,而无需在实验室培养基中生长。

为反向***学方法分析的第一个病原体是“Men B”(meningococcus,脑膜炎球菌),这是一种细菌病原体,占全球脑膜炎球菌性脑膜炎的50%。

通过反向***学设计的链球菌***含有四种蛋白质,可以为所有血型提供针对病原体的免疫。

随着这种方法得到越来越多的考虑,越来越多的***被设计出来针对有害病原体。这种方法还有助于对抗病原体耐药性的快速进化性质。

图2:反向***学研发流程示意图(Wenzhen Liao et al/ 2017)

方法和应用:

反向***学是一种现代***开发方法,涉及使用计算工具从病原体基因组中识别潜在的***靶标。这项技术彻底改变了***的设计方式,并导致开发针对各种传染病的有效***。继续寻找细节,我们将探索反向***学的方法和应用。

反向***学方法:

反向***学中使用的方法通常涉及生物信息学、基因组学、蛋白质组学和免疫学的组合。该过程通常涉及以下步骤:

1/对病原体的基因组进行测序:反向***学的第一阶段是对病原体的基因组进行测序。这可以通过下一代测序方法实现。

2/基因组序列分析:然后使用生物信息学技术研究基因组序列,以找到参与***力、发病机制或其他关键生物过程的基因。此步骤中使用各种方法和软件工具来预测蛋白质定位、鉴定结构域并评估可能的免疫原性

3/蛋白质组学分析:然后表达选定的基因,并使用蛋白质组学技术检查所得蛋白质以鉴定病原体表面的蛋白质。在此步骤中,使用质谱、2D 电泳和蛋白质微阵列等工具。

4/免疫学验证:然后测试鉴定出的蛋白质***动物或人类免疫反应的能力。这通常涉及使用动物模型或体外测定,例如 ELISA、蛋白质印迹和流式细胞术。此步骤旨在确认已确定靶标的免疫原性和保护潜力。

图3:反向***学研发方法示意图( Odir A/ Dellagostin et al/ 2017)

反向***学的应用:

反向***学已被用于开发针对多种传染病的***,包括细菌、病***和寄生虫感染。使用反向***学开发的***的一些例子包括:

1/Bexsero是一种预防脑膜炎奈瑟菌的***。Bexsero是第一种利用反向***学设计的***,它针对细菌表面暴露的蛋白质。

2/Prevnar 13是一种肺炎链球菌***。Prevnar 13靶向参与细菌胶囊发育的蛋白质,这是一个主要的致病因子。

3/Shingrix是一种带状疱疹***。Shingrix靶向病***表面的糖蛋白。

4/ Mosquirix是一种疟疾***,可预防恶性疟原虫,恶性疟原虫是导致疟疾的寄生虫。Mosquirix靶向寄生虫孢子体阶段的表面暴露的蛋白质。

5/针对COVID-19等新发传染病的***也已使用反向***学开发。该技术使研究人员能够快速发现SARS-CoV-2病***的可能***靶点,从而开发出许多成功的***,包括辉瑞-生物科技和莫德纳***。

反向***学的未来展望:

与标准***开发方法相比,它具有许多优势。它能够更合理、更有效地确定未来的***接种目标,并有可能加快***开发进程。它还可以发现在不同病原体菌株或血清型中保守的靶标,为广谱***的开发铺平道路。此外,反向***学可以揭示免疫原性较低的靶点,从而可以开发更有效且***反应更少的***接种。

个性化***的开发:

反向***学有可能用于开发个性化***。根据个人的特定遗传组成、免疫反应和环境暴露量身定制的***接种称为个性化***接种。反向***学提供了开发针对个人疾病暴露和免疫反应量身定制的***靶点的能力。这可能导致开发更有效、***反应更少的***。个体化***可能对那些感染特定疾病的高风险人群特别有益,例如免疫系统受损或有反复感染史的人。当典型的***开发方法可能不切实际时,个性化***还可以为罕见或新出现的传染病接种***。

反向***学的不足:

然而,利用反向***学开发量身定制的***接种存在重大障碍。需要来自个人的大量遗传和蛋白质组学数据来寻找定制的***接种目标是一个障碍。另一个障碍是大规模生产定制***接种的高成本和物流。尽管存在这些障碍,但定制***的潜在好处使其成为反向***学研究的关键领域。随着我们对免疫系统和病原体 - 宿主相互作用的理解不断增长,个性化***接种可能成为预防和治疗传染病的重要工具。

总结:

总而言之,反向***学是一种有效的***开发策略,它采用计算技术、基因组学、蛋白质组学和免疫学来寻找可能的***靶点。这项技术改变了***设计,从而发现了针对多种传染病的有效***。与传统的***开发方法相比,反向***学具有多种优势,包括能够找到在不同病原体菌株或血清型中保守的靶标,从而可以生产广谱***。此外,它有可能用于定制***,这可能对感染特定感染的高风险人群特别有益。 虽然使用反向***学开发个性化***仍然存在挑战,但其潜在好处使其成为***学领域的一个重要研究领域。

版权声明:标注原创仅代表原创编译,本平台不主张对原文的版权。本平台转载仅仅是出于学术交流和传播信息的需要,并不意味着代表本平台观点或证实其内容的真实性。转载文章版权归原作者所有,作者如果不希望被转载或有侵权行为,请联系本平台删除。

免责声明:
1. 《反向***学:定义、原理、方法和应用(深度长文|推荐收...》内容来源于互联网,版权归原著者或相关公司所有。
2. 若《86561825文库网》收录的文本内容侵犯了您的权益或隐私,请立即通知我们删除。